Prednáška doc. Tomáša Vinařa na Ústave informatiky

Ústav informatiky Prírodovedeckej fakulty UPJŠ v Košiciach pozýva študentov, pedagógov, výskumníkov aj odbornú verejnosť na prednášku doc. Mgr. Tomáša Vinařa, PhD., uznávaného odborníka v oblasti bioinformatiky, algoritmov, či dátovej vedy.

Prednáška sa uskutoční v stredu 26. novembra 2025 o 14:30 v miestnosti SJ2P11 a prinesie jedinečný pohľad na prepojenie informatiky s moderným biologickým výskumom, kde algoritmy zohrávajú kľúčovú úlohu pri analýze komplexných dát.

Tomáš Vinař vyštudoval informatiku na FMFI UK v Bratislave, študoval doktorandské štúdium na Univerzite vo Waterloo v Kanade, následne absolvoval postdoktorandský pobyt na Cornellovej univerzite v USA a od roku 2009 pracuje ako vysokoškolský učiteľ na FMFI UK v Bratislave, kde je zodpovedný za študijný program Dátová veda. Vo svojej vedeckej práci sa venuje bioinformatike, najmä štúdiu DNA rôznych organizmov od kvasiniek až po ľudí a ich príbuzných.

Abstrakt prednášky:

Bioinformatika patogénov

Sekvenovanie genómov sa stalo dôležitým nástrojom na identifikáciu a monitorovanie patogénov. V porovnaní s veľkými organizmami, kde našim cieľom je získať sekvenciu vysokej kvality pre detailnú analýzu, pri sekvenovaní patogénov je dôležitým faktorom čas a náklady. Vďaka tomu je sekvenovanie patogénov zdrojom zaujímavých výpočtových problémov a hľadanie nových metód má vysoký potenciál pre zlepšenie aplikovateľnosti výsledkov v epidemiológii či klinickej praxi. V rámci prednášky uvedieme dva príklady: identifikácia plazmidov z izolátov baktérií a genomické monitorovanie odpadovej vody na SARS-CoV-2. V oboch prípadoch lepšie algoritmy a modely pomáhajú zlepšiť kvalitu analýz veľmi zašumených dát.